Альфред Абердам родился 14 мая 1894 года в Кристинополе, Австро-Венгрия (ныне Червоноград, Львовской области) в семье банкира Моисея Абердама. Будущий художник получил традиционное еврейское образование. Вместе с тем, дом был полон книг Софокла, Данте, Шекспира, Мицкевича и Толстого.
В 1913 году Абердам отправился в Мюнхен, где изучал живопись в Академии художеств у Габриэля фон Хакла. Однако учёбу прервала начавшаяся Первая мировая война. Абердам был мобилизован в австро-венгерскую армию и направлен на восточный фронт, где, получив ранение, попал в русский плен. Находился в лагере военнопленных в Иркутске.
В 1917 году Абердам был назначен Народным комиссаром и организовал художественную школу в Иркутске. Там же в 1919 году он познакомился с Давидом Бурлюком, который вместе с другими футуристами гастролировал по Сибири с выставками и поэтическими выступлениями. Затем уже в Москве Абердам подружился с Владимиром Маяковским и Сергеем Есениным.
В 1922—1923 годах обучался в Краковской академии искусств, был учеником известных польских художников Теодора Аксентовича и Юзефа Панкевича. В 1922 году он впервые выставил свои работы на выставке «Общества любителей еврейского искусства» во Львове и на 4-й выставке еврейского искусства в Варшаве.
Позже продолжил учёбу в Берлине в мастерской Александра Архипенко, где встретился и подружился с Зигмундом Менкесем, Иоахимом Вейнгартом и Леоном Вайсбергом.
В 1924 году художник обосновался в Париже на Монпарнасе. Именно там учениками Архипенко была создана "Группу четырёх" (Le Groupe des Quatre). Художественные формы, представленные этой группой, были частью экспрессионистского движения "Парижской школы". Группа просуществовала до 1925 года, вместе они экспонировались в 1925 году в галерее Au Sacre du Printemps Жана Слевинского.
Абердан становится постоянным участником "Парижских салонов" (Independent и Tuileries), участвует в выставке современного польского искусства в галерее Éditions Bonaparte в 1929 году.
Ранние работы Абердама отличала пастозная свободная манера живописи, характерная для Ecole de Paris. Любимыми темами Абердама были материнство и одинокие женщины, читающие или о чем-то размышляющие.
В 1932 году Абердам организовал выставки во Львове (Музей художественной промышленности) и Варшаве (Еврейское общество пропаганды изобразительного искусства).
Вплоть до 1937 года, благодаря своему другу - художнику Марселю Слодки, Абердам получает заказы от швейцарских коллекционеров.
Во время немецкой оккупации Франции Абердам скрывается у своей подруги пианистки Анны Радлинска.
В 1944 году Абердам вступает в «Общество Еврейских Художников в Париже», возглавляемое скульптором Леоном Инденбаумом. Он становится секретарём, Марк Стерлинг и Зигмунд Шретер казначеями. Цель Общества – создать в Париже Еврейский Музей и организовать выпуск периодического издания, посвящённого еврейской культуре. Общество провело около двадцати собраний, первое из которых состоялось 15 сентября 1944 года.
После войны Альфред Абердам возвращается в свой дом в Париже. Он путешествует по Югу Франции, Швейцарии и Израилю.
В 1949 г. ретроспективная выставка Абердама состоялась в Париже в галерее Вильденштейна.
В 1949 и 1952 художник посетил Израиль, где проходили его персональные выставки в музеях Тель-Авива и Хайфы. Под влиянием этих путешествий он начал создавать композиции с силуэтами безликих фигур, живописные абстракции-размышления.
Выставки Абердама прошли также в Париже (1952), Лондоне (1961) и Тель-Авиве (1962).
В 1970 году в женевском Petit Palais была организована ретроспективная выставка работ художника.
В последние годы жизни он часто и подолгу бывал в Израиле. Его последняя персональная выставка прошла в Тель-Авивском музее (1963 г.).
Умер художник в своей парижской мастерской 3 декабря 1963 г. В 1970 году в женевском Музее современного искусства "Пти-Пале" прошла посмертная ретроспективная выставка Альфреда Абердама.